DECRYPTHON

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UPMC-Université Pierre et Marie Curie

UPMC-Université Pierre et Marie Curie.
L'UPMC, première université française, est un acteur incontournable de la recherche en génétique, génomique et protéomique. Le développement de ce type de recherche transdisciplinaire est une source de progrès considérable dans notre compréhension du monde vivant et dans ses méthodes d'analyse. Il permet d’appréhender le continuum qui va de la connaissance des génomes (génomique) à leur fonction (post-génomique), c’est-à-dire du gène et de sa régulation à la protéine et sa fonction, dans des contextes physiologiques et pathologiques.
 
Consciente des enjeux posés par la génomique et la post-génomique pour l’avancée des sciences et avec elles, de la société, l’UPMC soutient des recherches qui s’inscrivent dans des champs allant des sciences les plus fondamentales à des projets solidement ancrés dans le champ clinique ou celui des changements environnementaux altérant la biodiversité des écosystèmes de notre planète. Son projet le plus récent est la création d’une unité « Génomique des micro-organismes » qui vise à la compréhension des interactions entre micro-organismes entre eux, un vaste domaine encore peu exploré par les approches génétiques et génomiques et qui réunira les dimensions in silico et naturalistes.
Forte des différentes disciplines développées dans ses laboratoires, l’UPMC en connecte les acteurs, un élément incontournable pour la réussite des recherches en génomique et protéomique qui requièrent des approches multidisciplinaires émargeant à la chimie, la physique et les mathématiques pour les aspects de modélisation. Les données de la génomique et post-génomique nécessitent un traitement biostatistique et bioinformatique. Plusieurs équipes de l’UPMC sont expertes dans le traitement du signal et leur contrôle de qualité, la gestion de base de données de grandes tailles, l’exploitation statistique et la modélisation des données. Le projet de modélisation HCMD piloté par l’équipe « Génomique analytique » de l’UPMC en est une illustration des plus probantes et pourrait déboucher sur l’élaboration de nouveaux traitements pour les maladies neuromusculaires.
Enfin, l’UPMC dispose de réseaux de plate-formes cruciaux dans la réussite de cet axe de recherche. A titre d’exemple, la plate-forme de post-génomique (P3S) est une mine d’or pour la communauté scientifique. Situés à la Pitié Salpêtrière, ces équipements à la pointe de la technologie permettent de déterminer les profils d’expression des gènes et le génotypage de marqueurs génétiques, polymorphismes SNPs, à haut débit.

Pour plus d’informations : http://www.upmc.fr/

Les universités partenaires

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Les universités suivantes hébergent les supercalculateurs de la grille universitaire


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Ces universités sont reliées entre elles par le biais du réseau à très haut débit RENATER (Réseau National de Télécommunications pour l’Enseignement et la Recherche)
Le Centre de ressources informatiques de Haute Normandie, le Crihan, à Rouen est également contributeur du programme, il héberge des bases de données très volumineuses.

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